compcogneuro/sims: ClusterPlot
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出典とライセンス
原典: https://github.com/compcogneuro/sims/blob/main/ch3/faces/ClusterPlot.md
ライセンス: BSD 3-Clause。このページは日本語翻訳であり、変更点は翻訳とサイト内整形です。
クラスター プロットは、階層的にクラスター化された樹形図内の一連のパターン間の類似関係を表示します。多くの場合、これは高次元の類似構造を視覚化する最も便利な方法です。クラスター プロットを生成する方法については、taDataAnal ページを参照してください。
クラスター プロットを作成するアルゴリズムは、最も類似したパターンをグループ化し、次にパターンのグループを高次のクラスターにグループ化する再帰的なプロセスです。これは、最も近いアイテムまたはグループのみをグループ化することに「貪欲」であり、まだグループ化されていないものが何も残らなくなるまで続行されます。
プロットを読むには、ツリー内で最も類似した「葉」が含まれる右側から始めます。共通の垂直バーを共有し、その共通の垂直バーに水平線で接続されているアイテムは、すべて同じレベルの類似性でグループ化されます。多くの場合、これはアイテムのペアですが、複数のアイテム間の類似性が同じレベルである場合は、それらをすべてグループ化できます。 1 レベル左に戻ると、それ自体がクラスター内にグループ化されているグループは、他のそのようなグループ化と比較して、それぞれの項目間で共有される類似性が高くなります。等々..
水平線の長さは、グループ内の項目間の距離を示します。通常、これは ユークリッド 距離メトリック (つまり、差の二乗和の平方根) を使用して計算されますが、他にも多くの距離メトリックが利用可能です。
葉に垂直線のみが表示され、水平線セグメントが表示されない場合は、それらのアイテム間の距離がゼロであることを意味します。
切断されたクラスター間のクラスターの水平位置の長さに絶対的な意味はありません。距離は、共有クラスター内の項目についてのみ正確です。