OpenSourceBrain Documentation: 計算神経科学におけるオープンコラボレーション: [CNS2015](http://www.cnsorg.org/cns-2015-workshops-program) でのワークショップ
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出典とライセンス
原典: https://github.com/OpenSourceBrain/Documentation/blob/main/source/General/Meetings/CNS_2015.md
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計算神経科学におけるオープンコラボレーション: CNS2015 でのワークショップ
午前 9 時～午後 5 時、2015 年 7 月 23 日木曜日、経済大学、プラハ、チェコ共和国
生物物理学的および解剖学的に詳細なニューロン ネットワークの構築と分析は複雑で時間のかかる作業であり、さまざまな背景と技術スキルを持つ研究者が参加することが理想的です。ただし、ほとんどの研究室では、これらの研究者全員がいつでも参加できることを期待できません。これにより、プロジェクトが停滞し、データやソフトウェアが失われ、実験や計算作業が不必要に繰り返される可能性があります。
これらの問題に対処するための多くの取り組みが開始されています。このようなモデルを制約するために、自由に利用できるデータを使用して公開リソースを作成している人もいます。オープンソース ソフトウェア開発のベスト プラクティスを利用して、共同作業環境でのモデルの構築と共有を奨励している企業もいます。このワークショップは、これらのプロジェクトへの有益な紹介としてだけでなく、これらの取り組みの開発者向けにコミュニティからフィードバックを得て要件を収集するためのディスカッション フォーラムとしても機能しました。
主催者: Padraig Gleeson (ユニバーシティ・カレッジ・ロンドン) & Aurel A. Lazar (コロンビア大学)
プログラム
| 時間 | プレゼンター | タイトル/件名 |
|---|---|---|
| 9:00 | はじめに/ようこそ | |
| 9:01 | ジャン・アントリク (CNRS) | ニューロン モデリングにおけるコラボレーション: モデルの共有、ワークフロー、来歴 |
| 9:30 | ニコラス・ケイン (アレン脳研究所) | アレン脳研究所 (スライド) でのオープン コラボレーションのためのリソース |
| 10:00 | コーヒーブレイク | |
| 10:30 | パドレイグ・グリーソン (ユニバーシティ・カレッジ・ロンドン) | ニューロML と オープンソース ブレイン イニシアチブ (スライド) |
| 11:00 | エイドリアン・キンタナ (ユニバーシティ・カレッジ・ロンドン) | ゼペット: ニューロン モデルのオンライン視覚化とシミュレーション (スライド) |
| 11:30 | ライトニング トーク | マイケル ソンタグ NIX プロジェクト: 神経科学データとメタデータの包括的ストレージ (スライド) ヴィクター ジルサ 仮想脳 チャイタニヤ チンタルリ NSDF: 神経科学シミュレーション データ形式 (スライド) |
| 12:00 | 昼食 | |
| 13:30 | Matteo Cantarelli (MetaCell Ltd) | オープンワーム (スライド) |
| 14:00 | オーレル A. ラザール (コロンビア大学) | ニューロカーネル: ショウジョウバエの脳をエミュレートするためのオープンソース プラットフォーム |
| 14:30 | ビル リットン (SUNY ダウンステート メディカル センター) | モデルDB (スライド) |
| 15:00 | コーヒーブレイク | |
| 15:30 | エイリフ・ミュラー (EPFL) | 統合モデリング コミュニティ用の 人間の脳プロジェクト リソース (スライド) |
| 16:00 | シュリージョイ トリパシー (ブリティッシュ コロンビア大学) | 電気生理学データと Neuroelectro.org (スライド) をオープン |
| 16:30 | オープンディスカッション | |
| 17:00 | まとめ |
このワークショップに関するお問い合わせは、パドレイグ・グリーソン (p.gleeson -at-ucl.ac.uk) までお問い合わせください。