OpenSourceBrain Documentation: OSB ワークショップ 2014: 皮質モデルの構築と共有
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出典とライセンス
原典: https://github.com/OpenSourceBrain/Documentation/blob/main/source/General/Meetings/OSB_2014.md
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OSB ワークショップ 2014: 皮質モデルの構築と共有

この会議は、オープンソース・ブレイン・イニシアチブ の 2 回目の主要会議でした。
日程: 2014年5月14日水曜日午前9時~午後5時16日金曜日
地元主催者: セルヒオ・ソリナス)、Irene Solinas 組織委員会: パドレイグ・グリーソン)、エウジェニオ・ピアジーニ、アンガス・シルバー、ボリス・マリン
会議の焦点
皮質の接続性と発火特性に基づいた漏洩統合および発火ニューロンのネットワークから、マルチコンパートメントのコンダクタンスに基づく細胞モデルまで、開発され公開されている皮質細胞およびネットワーク モデルの数が増加しています。これらの多くは、世界中の研究室で新たな科学的疑問に対処するために再利用、再実装、拡張されています。
この会議では、広く関心を集めているさまざまな皮質視床モデルを検討し、これらを NeuroML や PyNN などの標準化された形式で公開のオープンソース リポジトリに入れるための最良の方法について議論しました。私たちは、これらのモデルが十分にテストされ、注釈が付けられ、参加者やより広範なコミュニティが研究ツールとして使用できるようにするために必要な手順を調査しました。
これらのモデルを制約するデータを作成している実験者だけでなく、モデルを構築、シミュレーション、分析、共有するためのインフラストラクチャを作成しているシミュレータやアプリケーションの開発者からもプレゼンテーションがありました。
スピーカー
ジュゼッペ・チンデミ、ブルーブレインプロジェクト、EPFL、スイス
シャロン・クルック)、アリゾナ州立大学、米国
エジディオ・ダンジェロ、パヴィア大学、イタリア
マルクス・ディースマン、研究センター ユーリッヒ、ドイツ
ダーク・フェルドマイヤー、アーヘン大学、ドイツ
アロン・コーングリーン)、バルイラン大学、イスラエル
リンダ・ラニヨン、国際神経情報学調整施設、ストックホルム、スウェーデン
デイブ・レスター)、SpinNakerプロジェクト、マンチェスター大学、英国
ロバート・A・マクドゥーガル、エール大学医学部、米国
ミケーレ・ミリオーレ、イタリア国立研究評議会および米国イェール大学医学部
オーレ・ポールセン、ケンブリッジ大学、英国
オラシオ・G・ロットスタイン、ニュージャージー工科大学、ニューアーク (ニュージャージー州) 米国
アンガス・シルバー)、ユニバーシティ・カレッジ・ロンドン
ヴェルナー・ファン・ゲイト、ブルーブレインプロジェクト、EPFL、スイス
ティム・ヴォーゲルス、オックスフォード大学、英国
ダニエル・ウォジク)、Nencki Institute、ポーランド
議題
5 月 13 日火曜日のメイン OSB 会議に先立って、NeuroML 編集委員会 会議が開催されました。
この会議の議事録は ここ でご覧いただけます。
5月14日水曜日、午前9時~午後6時
| 午前のセッション | ||
|---|---|---|
| Open Source Brain イニシアチブへのようこそと背景 | ||
| アンガス シルバー | はじめに | スライド |
| パドレイグ・グリーソン | OSB の概要と NeuroML との関係 | スライド |
| エイドリアン・キンタナ | オープンソース Brain の使用 | スライド |
| 他の取り組みとの関係 | ||
| ロバート・マクドゥーガル | ModelView: モデル構造を抽出し、NEURON を使用して Web 上に表示する | スライド |
| リンダ・ラニヨン | 国際神経情報学調整施設 | スライド |
12:30-13:30 ランチ
| 午後のセッション | |||
|---|---|---|---|
| 個々の皮質ニューロンの詳細なモデリング | |||
| アロン・コーングリーン | 皮質錐体ニューロンの現実的なモデリング | スライド | |
| アンガス シルバー | In Vivo のようなネットワーク活動から生じるグルタミン酸結合 NMDAR は、L5 皮質錐体細胞モデルの時空間統合を拡張する | 文献情報 | J-GLOBAL 科学技術総合リンクセンター |
| Guy Eyal | 樹状突起は軸索のエンコード能力に影響を与える | スライド | |
| ヴェルナー・ヴァン・ゲイト | 新皮質微小回路の再構築: ニューロン |
5月15日木曜日、午前9時~午後6時
| 午前のセッション | ||
|---|---|---|
| 実現するテクノロジー | ||
| デイブ・レスター | SpinNNaker ソフトウェアとオープン スタンダード | スライド |
| マテオ カンタレッリ | Geppetto: Web ベースのマルチスケール シミュレーター | スライド |
| ロバート・キャノン | NeuroML および LEMS 向けに開発中の新機能と機能 | スライド |
| 大脳皮質のネットワークモデル | ||
| ティム・ヴォーゲルス | 興奮と抑制のダンス |
12:30-13:30 ランチ
| 午後のセッション | ||
|---|---|---|
| マルクス ディーズマン | 局所皮質ネットワークの実物大スパイクモデル | スライド |
| ジュゼッペ チンデミ | 新皮質微小回路の再構築: 接続性とシナプス | |
| ダニエル・ウォジク | 視床皮質ループの大規模モデルにおけるシミュレーションデータの生成から公開まで | スライド |
| チャイタニヤ チンタルリ | 皮質スライス標本における細胞外電位のモデリング | スライド |
| ダーク・フェルドマイヤー | 興奮性ニューロンと抑制性ニューロンの形態とシナプス接続に対するそれらの関係 |
5月16日金曜日、午前9時~午後6時
| 午前のセッション | ||
|---|---|---|
| OSB Symposium: Oscillation and resonance in CNS network loops | 主催者: セルヒオ・ソリナス) このシンポジウムは、この分野におけるモデルとツールの統合を促進するために、OSB の枠組み内でニューロンネットワーク振動の分野で積極的に研究している神経科学者を集めることを目的としています。詳細については、ここを参照してください: [[Symposium2014]] | |
| オラシオ G. ロットスタイン | Inhibition-based theta resonance in a hippocampal network: a modeling study | スライド |
| オーレ・ポールセン | Oscillations and resonance in hippocampal neurons. | |
| ミケーレ ミリオーレ | Modeling the effects of electric fields from power lines on hippocampal CA1 pyramidal neurons. | |
| エジディオ ディアンジェロ | Theta-frequency resonance at the cerebellum input stage improves spike timing on the millisecond time-scale |
12:30-13:30 ランチ
| 午後のセッション | ||
|---|---|---|
| 今後の予定 | ||
| ボリス マリン | OSB のモデルのテストと検証のフレームワーク | スライド |
| シャロン・クルック | NeuroML 開発: 編集委員会報告書 と NeuroML データベースの計画 | |
| パドレイグ・グリーソン | OSB の要件収集: 計算神経科学における真の協調モデル開発には何が必要ですか? |
お問い合わせ
このミーティングに関するご質問がございましたら、お気軽に [email protected] までご連絡ください。
サポート
この会議は以下の方々から多大なご支援をいただきました。
シンポジウムのスポンサー:
イラスト提供: マテオ・ファリネッラ)