OpenSourceBrain Documentation: NWBE
このページは外部資料の日本語訳です。原文の見出し順と本文順を保ち、コード・URL・出典表記はできるだけ原形のまま残しています。
出典とライセンス
原典: https://github.com/OpenSourceBrain/Documentation/blob/main/source/OSBv2/NWBE.md
ライセンス: CC BY 4.0。このページは日本語翻訳であり、変更点は翻訳とサイト内整形です。
NWB Explorer は、科学者が NWB:N 2 ファイルの内容を読み取り、視覚化し、探索するために使用できる Web アプリケーションです。
NWB Explorer のインスタンスは OSBv2 でホストされています。
複数の NWB ファイルを視覚化し、ノートブックを作成してファイルに含まれるデータを分析し、作業内容を保存/共有できるようにするには、OSBv2 で 応用 として NWB エクスプローラーを開くことができます。これを行うには登録/ログインする必要があります。
NWB Explorer へのクイック アクセス
NWBE は OSBv2 に統合されており、NWB ファイルを含む ワークスペース を開くための 応用 として使用できますが、このアプリケーションの スタンドアロン バージョン には (ログインせずに) http://nwbexplorer.opensourcebrain.org. でアクセスできます。
これには、多数のサンプル NWB ファイルへのリンクが含まれており、公的にアクセス可能な NWB ファイルへの URL を入力して、その内容を視覚化できます。
サンプル ファイルと、外部でホストされている NWB ファイルへの URL を貼り付けるオプションを備えた NWB エクスプローラーへのメイン インターフェイス。
NWBE で NWB ファイルを開くための直接リンク (URL) の構築
ドキュメントで使用するために、NWBE で NWB ファイルを開くための直接リンク (URL) を構築することができます。 URL の形式は次のとおりです。
http://nwbexplorer.opensourcebrain.org/nwbfile=<path to file>
GitHub でホストされているファイル
たとえば、GitHub でホストされているファイルの場合、これは次のようになります。
http://nwbexplorer.opensourcebrain.org/nwbfile=https://github.com/openworm/WormsenseLab_ASH/raw/main/test_data/07-06-25-1.nwb
NWBE がファイルをダウンロードできるように、ファイルの URL は「生」の URL である必要があることに注意してください。
これを使用したバッジの例:
DANDI でホストされているファイル
DANDI でホストされている NWB ファイルの場合、「ダウンロード」ボタンを右クリックして取得したファイルへの直接 URL を使用できます。例:
http://nwbexplorer.opensourcebrain.org/nwbfile=https://api.dandiarchive.org/api/assets/0acc0d47-a8c6-4971-8130-32b0b331c838/download/
これを使用したバッジの例:
Figshare でホストされているファイル
Figshare でホストされている NWB ファイルの場合、「ダウンロード」ボタンを右クリックして取得したファイルへの直接 URL を使用できます。例:
http://nwbexplorer.opensourcebrain.org/nwbfile=https://figshare.com/ndownloader/files/34273955
これを使用したバッジの例: