OpenSourceBrain 翻訳ページ
OpenSourceBrain Documentation: OSB を始める
このページは外部資料の日本語訳です。原文の見出し順と本文順を保ち、コード・URL・出典表記はできるだけ原形のまま残しています。
出典とライセンス
原典: https://github.com/OpenSourceBrain/Documentation/blob/main/source/General/GettingStarted.md
ライセンス: CC BY 4.0。このページは日本語翻訳であり、変更点は翻訳とサイト内整形です。
OSB を始める
現在、OSB には OSBv1 と現在開発中の新しいバージョンである OSBv2 の 2 つのバージョンがあります。
- OSBv1 は、さまざまな脳領域および種から ニューロML2 形式で標準化されたモデルを共有、表示、分析、およびシミュレーションするための Web プラットフォームです。これは、グリーソンら。 2019年 で詳しく説明されているバージョンです。
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OSBv2 は、OSBv1 の機能に基づいて構築された新しい統合研究プラットフォームです。 これは、神経科学者が実験データとデータ駆動型の計算/理論モデリングの間のループを閉じるのを支援することを目的としています。 以下を統合します。
- NWB エクスプローラー (NWB) 形式のデータの視覚化と分析用
強力なクラウドベースの Web アプリケーションで。 研究者は、OSBv2 上のワークスペースに作業内容を保存し、それを日々の研究に使用できます。
OSB のどのバージョンを使用すればよいですか?
OSBv1 を使用してください:
- グリーソンら。 2019年 グリーソン2019 で説明されているモデルを調べたい場合
- Web ブラウザで ニューロML2 モデルを視覚化、分析、シミュレーションしたい場合
OSBv2 を使用してください:
- 標準化された NWB 形式で神経科学データを共有、視覚化、分析したい場合
- NetPyNE プラットフォームを使用して計算モデルを作成、シミュレーション、共有したい場合
- Python エコシステム (ニューロML2 を含む) のパッケージを使用して、一般的な Python ベースのワークフローを作成および共有したい場合
OSBv2 はクラウド ベースのインフラストラクチャを使用するため、提供されたクラウド ストレージ自体に作業とデータを保存し、後で中断したところから続行できます。
OSBv2 は現在鋭意開発中であり、OSBv1 のすべての機能は時間の経過とともに OSBv2 に移行される予定です。