OpenSourceBrain Documentation: オープンソース ブレイン v2
このページは外部資料の日本語訳です。原文の見出し順と本文順を保ち、コード・URL・出典表記はできるだけ原形のまま残しています。
出典とライセンス
原典: https://github.com/OpenSourceBrain/Documentation/blob/main/source/OSBv2/Overview.md
ライセンス: CC BY 4.0。このページは日本語翻訳であり、変更点は翻訳とサイト内整形です。
オープンソース ブレイン v2
OSBv2 が公開されました!
OSBv2 の最新リリースは https://v2.opensourcebrain.org. で入手できます。質問がある場合、またはユーザー テストを支援したい場合は、連絡する を実行してください。
Open Source Brain (OSB) v2 は、OSBv1 の機能に基づいて構築された新しい統合研究プラットフォームです。 現在鋭意開発中ですが、ユーザーが研究で使い始めるのに十分安定しています。
OSBv2 は、リポジトリ、ワークスペース、アプリケーションという 3 つの主要な概念を中心に構成されています。

OSBv2 上のリポジトリ、ワークスペース、アプリケーション間の関係
リポジトリ
リポジトリは、GitHub、フィグシェア、DANDIアーカイブ などの公開リソース内のファイルとデータのセットのビューです。
- OSBv2 のリポジトリ ページには、リモート リソース (GitHub リポジトリ、FigShare プロジェクトなど) の 現在のコンテンツ がリストされます。
- OSB リポジトリはパブリックです。すべてのユーザーは OSBv2 に追加された リポジトリを参照する を実行できます。
- プライベートリポジトリ、および他の神経情報学リソースへのインターフェースも計画されています
リポジトリの詳細については、ここ を参照してください。
ワークスペース
ワークスペースは、ユーザーが作業を実行するための永続的なスペースです。
- 空のワークスペースを作成したり、その時点でリポジトリ内のファイルの一部またはすべてを使用して OSBv2 リポジトリ からシードしたりできます。
- 各ワークスペースは 永続的なクラウド ボリューム に保存されるため、ユーザーは作業を保存して後で再開できます。
- ワークスペースは任意の OSBv2アプリケーション で開くことができ、生成されたファイル (解析出力、シミュレーション結果など) もワークスペースに保存され、他のファイル アップロードできます
- ユーザーは自分のワークスペースをプライベートのままにすることも、パブリックにしてコミュニティと共有することもできます
ワークスペースの詳細については、ここ を参照してください。
アプリケーション
OSBv2 は研究者が使用できる多数のアプリケーションを統合しており、サポートされている OSBv2 アプリケーションのいずれかでワークスペースを開くことができます。
- NWB エクスプローラー: 国境なきニューロデータ ファイルの内容の対話型の探索/視覚化用
- NetPyNE: 神経科学モデルの構築とシミュレーションのためのグラフィカル ユーザー インターフェイス
- ジュピターラボ: Python プログラミング言語の完全な開発環境
NWB エクスプローラー と NetPyNE の両方には、アドホック スクリプト作成と分析用の組み込み Python コンソールも含まれており、便宜上、多数の Python ライブラリが ジュピターラボ アプリケーションにプリロードされています。
OSBv2 アプリケーションの詳細については、ここ を参照してください。